对印度关于愿意和谈的表示产生了怀疑。这位巴基斯坦女总理在英联邦首脑会议期间对记者说：“虽然他们表示要会谈，但却有更多的人被杀害。”
10月28日，巴基斯坦和印度在有争议的克什米尔地区停火线一带加紧相互炮击行动。巴基斯坦外交部说，印度武装部队加紧对靠近停火线的平民区进行炮轰，企图转移世人对其军队包围哈兹拉特巴尔清真寺内武装穆斯林的注意力。印度国防部的一位发言人则说，巴基斯坦军队加紧炮轰印度边境村庄和军事据点，力图使印度安全部队和好斗分子在哈兹拉特巴尔清真寺出现的13天之久的僵持局面国际化。
哈兹拉特巴尔清真寺风波使巴印之间的关系下降到一个新低点，但双方都希望避免发生大的对抗。
1993年10月24日深夜，出席塞浦路斯英联邦会议的印巴两国代表紧急磋商，终于达成了协议，使紧张局势出现了一丝转机。
11月初，贝·布托宣布暂停巴基斯坦的核计划。但是，这一决定触动了全国的神经，并且使人想到了贝·布托的父亲，前总理佐·阿·布托曾经发誓要不惜一切代价为巴基斯坦制造一颗原子弹。佐·阿·布托曾说：“如果印度研制原子弹，我们也必须研究原子弹，即使我们吃草和树叶或忍饥挨饿，也在所不惜。”因此，贝·布托的话刚一出口就立即遭到反对派的群起而攻之，他们指责贝·布托损害国家利益。在这种情况下，11月24日，贝·布托排除了削减巴基斯坦核计划的任何可能性。她说，巴基斯坦发展核力量是为了威慑印度。
同一天，巴基斯坦外交秘书哈里亚·穆罕默德·汗和印度外交秘书迪克西特在一项联合声明中说，他们将从1994年1月1日起开始在伊斯兰堡举行为期3天的会谈。巴基斯坦外交部一些官员表示对会谈取得进展不抱多大希望，巴基斯坦将重申让克什米尔人民自决的要求。
进入1994年，印巴在克什米尔问题上仍是吵闹不休，边境冲突迭起。
1月27日，印度军队在印占克什米尔打死21名穆斯林居民。
2月5日，巴基斯坦举行全国总罢工，声援克什米尔穆斯林反对印度统治的斗争，数万人在拉瓦尔品第举行集会。
同时，在边界的另一边，数以万计的印度人上街游行，抗议伊斯兰堡对印占克什米尔分离主义者的支持。
在卡拉奇，警察以催泪弹和棍棒驱赶企图向印度领事馆进发的示威者。在伊斯兰堡，一个在印占克什米尔进行战斗的激进组织的7名成员，在印度使馆外面举行了两个小时的静坐示威。这一天，巴基斯坦的所有政府部门、商业银行、私营企业、市场和商店，甚至饭馆都关闭了。
伊斯兰堡的报纸说这一天的行动主要是抗议印度总统夏尔马对贝·布托的人身攻击。夏尔马说贝·布托“已丧失了印度、巴基斯坦和所有宗教美德的基本价值”。巴基斯坦报纸发表的官方声明说：“这一人身攻击不仅是毫无根据的，而且也违背了有关两个主权国家之间文明行为的准则。”巴基斯坦外交部也将一份抗议照会交给了印度驻伊斯兰堡高级专员。
3月20，巴基斯坦外交部发言人说，“由于印度当局采取不合作和消极的态度”，巴基斯坦决定关闭驻印度孟买的领事馆，决定“立即生效”。同一天的巴基斯坦报纸援引巴基斯坦一位高级军官的话说，印度计划同巴基斯坦打一场“有限战争”。巴基斯坦虽未在其边界一方部署重兵，但是“能够有效地对付敌人的威胁”。他还说印度在克什米尔拥有大约60万军队。
5月8日，贝·布托到西北边境省阿伯塔巴德城视察时说，巴基斯坦希望边境安宁，但是不会向任何人屈服，不会为了友谊而放弃原则。贝·布托说：“克什米尔属于克什米尔人，只有克什米尔人才能决定他们的命运。”“我们已经看到柏林墙的倒塌、苏联的解体，现在我们又将目睹当选南非总统的纳尔逊·曼德拉的就职典礼。这表明想通过镇压来征服克什米尔人的企图是注定要失败的。”贝·布托向克什米尔人保证，巴基斯坦政府、武装部队和人民将继续支持其“自由斗争”。
此后，印巴两国之间的舌战逐渐升级。
8月14日，巴基斯坦总理贝·布托在独立日这一天把克什米尔争端比喻成南亚次大陆分治遗留下来的“未完成的议事日程”，并说伊斯兰堡总是支持反抗印度统治的克什米尔人。
8月15日，印度总理拉奥在印度独立47周年之际向全国发表的电视讲话中称，贝·布托的讲话证明伊斯兰堡正在援助穆斯林好斗分子。拉奥坚持要求得到整个被冲突困扰的克什米尔地区，说伊斯兰堡必须把它占领的克什米尔地区归还给新德里。
8月30日，巴基斯坦宣布驱逐印度驻卡拉奇领事馆的领事J·J·辛格。当天的晚些时候，印度外交部一位高级官员召见巴基斯坦驻印度使馆副高级专员，并通知他印度要把巴基斯坦高级专员公署的一秘贾维德·艾哈迈德驱逐出境。印度和巴基斯坦都说，受牵连的外交官是因卷入与其官方身份不相符的活动而被驱逐的。印度和巴基斯坦互相驱逐外交官之后，关系变得日趋紧张。
8月31日，巴基斯坦指责印度支持恐怖活动，竭力想搞乱这个国家，声称“如果南亚存在一个恐怖国家，那就是印度”。印度政府则指责巴基斯坦去年在孟买策划了一连串的炸弹爆炸事件，一天之内就炸死了300多人。印度还指责巴基斯坦向那些正在查谟和克什米尔邦进行叛乱活动的反叛分子提供武器。巴基斯坦否认了这些指控。印度人民党的发言人夏尔马在这一天说：“印巴局势正日趋紧张很清楚，克什米尔是争端的根本起因。改进两国关系的唯一具体步骤可能是根据谈判解决这个问题。”
12月2日，在克什米尔南部城市查谟附近的边界地区，印度和巴基斯坦军队相互交火，至少有4人丧生。此后交火事件时断时续，但没有引发大规模武装冲突。
12月27日，巴基斯坦关闭印度在卡拉奇的总领事馆。贝·布托总理称这一决定是“令人不快的”，但为了国家安全而不得不做出这一决定。贝·布托在卡拉奇向一群学生演讲时说，巴基斯坦政府有“无可辩驳的”证据可以证明印度领事馆卷入了卡拉奇的“恐怖”活动。贝·布托说，几名被捕的恐怖主义分子已经承认他们在印度受过训练。她说，“恐怖主义”必将迫使巴基斯坦放弃它在克什米尔问题上的立场。
印度对巴基斯坦的决定提出了抗议。印度指责巴基斯坦因自己未能控制卡拉奇的暴力活动而关闭印度在这个港口城市的领事馆的做法。印度外交国务部长古南丹·拉尔·巴蒂亚说，巴基斯坦的这种举动“违背了所有的外交准则”。他说印度再三提出与巴基斯坦举行会谈，以解决包括克什米尔问题在内的所有争端。“尽管巴基斯坦最近采取了这样的行动，但是我们的态度将不会改变。”
印巴两国在争吵中度过了1994年。然而，进入1995年，两国的关系仍难以平静。
新年伊始，l月15日，印度政府便要求巴基斯坦在一个月之内从驻新德里使馆撤走15名外交人员。巴基斯坦认为，印度此举是为了报复巴基斯坦在1994年年底，以印方涉嫌卡拉奇恐怖活动为由下令关闭印度驻卡拉奇总领事馆。
进入1995年，卡拉奇的恐怖流血事件日益增多，并不断升级。对这一系列暴力事件，贝·布托和巴基斯坦其它高级官员指责印度是插手恐怖活动的势力之一。贝·布托在3月11日说：“我们抓住了一些人，这些人都在国外受过训练。”她指的显然是印度。
印巴两国围绕克什米尔问题的争端，引起了国际社会的极大关注。人们担心这场争端引发第四次印巴战争，给南亚的局势带来更大的震荡。英美等国参与了调解印巴矛盾的活动。1995年刚一开始，英美便在制止印巴滑向对抗方面做出了努力。
l月9日，英国外交大臣道格拉斯·赫德在伊斯兰堡呼吁印度和巴基斯坦以和平方式解决克什米尔问题。他在举行的记者招待会上说：“巴基斯坦和印度之间应就克什米尔问题进行对话，只有采取政治的而非暴力的方式并停止一切外部力量对暴力活动的支持，才是解决克什米尔问题的途径。”他还强调应该派国际观察员进入克什米尔地区。
l月15日，贝·布托总理在伊斯兰堡会见了来访的美国国防部长威廉·佩里。佩里听取了贝·布托对当前印控克什米尔局势的介绍。针对贝·布托要求美国为解决克什米尔问题发挥更大作用的建议，佩里向贝·布托保证美国将公正和公平地处理它与巴基斯坦和印度的关系。6月24日，美国驻印度大使及五名美国高级外交官抵达克什米尔，进行为期四天的访问，以使掌握有关克什米尔问题的第一手材料，评估居间调停的可能性。
然而，印巴双方在克什米尔问题上的立场是难以弥合的。印度总理拉奥对国人说：“不管有还是没有巴基斯坦，克什米尔总是印度不可分割的一个组成部分。”贝·布托则反唇相讥，她说：“从地理和政治上讲，巴基斯坦如果没有克什米尔就是不完整的。”
印巴两国人民在经历了三次战争之后，都渴望和平，希望克什米尔问题能够得到和平解决。
1995年2月23日，印一巴和平与民主人民论坛发起召开民间讨论会，来自两国的2000名新闻界、学术界、文艺界、医务界、律师组织及促进和平与和睦事业组织的人士参加了为期两天的会议。会议呼吁印巴两国政府结束“对抗政治”，采取积极步骤促进查谟7—克什米尔地区实际控制线两边的和平，并在这一地区建立民主进程。会议认为，双边争端不应诉诸武力。两国应共同努力，“均衡裁减常规部队”，增加双方在上述地区兵力的“透明度”。
克什米尔呼唤和平。然而，印巴双方在克什米尔问题上的深刻而复杂的矛盾，难以在短时期内弥和。尽管两国政府和人民都有和平的愿望，但事物的发展却是不以人们的意志为转移的。
1995年5月，印巴两国围绕克什米尔问题，争端再起，关系又趋紧张。
5月11日黎明，在印占克什米尔圣城沙拉尔谢里夫，印军同要求克什米尔从印度统治下独立的穆斯林分离主义者之间再次发生了大规模流血冲突。在激烈的冲突中，克什米尔最神圣的地方之一谢赫·努尔丁·瓦利圣寺被大火焚烧，受到严重毁坏。谢赫·努尔丁·瓦利是克什米尔的守护神，它受到居住在克什米尔的所有居民包括穆斯林、印度教徒和锡克教徒的尊崇。因此，已有650年历史的谢赫·努尔丁·瓦利圣寺被毁，触动了克什米尔最敏感的神经，激起了各方的强烈反应，并再次引发印巴两国间的紧张关系。
事件发生后，巴基斯坦政府严厉谴责印度毁坏圣寺的行径。巴基斯坦外交部在一项声明中说：“巴基斯坦政府谴责这种有意公开侮辱全世界穆斯林良心的渎圣行径。”声明敦促印度政府“结束在被占克什米尔的镇压行径，撤走其规模巨大的占领军，允许克什米尔人民享有联合国决议所保证的决定自己的未来的权利。”在巴基斯坦各地和克什米尔巴方控制区，愤怒的穆斯林群众举行了抗议活动。
印度政府在事发后指责巴基斯坦策划了毁坏圣寺的事件，并警告巴基斯坦不要干涉印度的内政。印度内政国务部长皮洛特说，如果伊斯兰堡不停止支持克什米尔闹分裂的游击队，就对巴基斯坦采取报复行动。针对穆斯林分离主义组织扬言要对印度城市发动城市游击战以报复圣寺被毁，印度政府加强了其与巴基斯坦边界的警戒，并说它有能力反击穆斯林分离主义渗透者对印度的任何恐怖主义袭击。
5月13日，针对印度内政国务部长皮洛特对巴基斯坦发出的含蓄的战争威胁，巴基斯坦政府呼吁联合国所有成员国对印度施加压力，以制止其对伊斯兰堡发出战争威胁，并使其在处理有争议的克什米尔地区问题上表现出克制态度。巴基斯坦外交部长艾哈迈德·阿里在伊斯兰堡对记者说：“请敦促印度不要对巴基斯坦发出战争威胁，敦促它保护宗教圣地并保证克什米尔人民的人权。”阿里说，皮洛特最近发表的“非常不负责任的讲话破坏了这一地区的政治和安全气氛”，“印度领导人每当自己的如意算盘破产时，就开始对巴基斯坦进行威胁，这已经成了他们长期以来的惯用伎俩”。巴基斯坦不得不认真对待印度发出的战争威胁。
事件发生后，尽管印度当局在印占克什米尔首府斯利那加实行了戒严，但一些好斗的穆斯林不顾严厉的戒严令，同印度保安部队继续发生冲突。5月14日，在斯利那加的至少8个地点仍有成群的人朝保安部队投掷石块，局势仍很混乱。查谟和克什米尔邦政府发言人说：“克什米尔谷地的气氛令人痛心。”
谢赫·努尔丁·瓦利圣寺被毁事件也在印度国内引起强烈震动。在5月15日举行的议会会议上，印度反对党因拉奥总理未能阻止在克什米尔发生的圣寺被毁事件而一致要求拉奥总理引咎辞职。反对党指责拉奥总理把克什米尔穆斯林反政府活动处理得一团糟。他们还要求对拉奥政府进行不信任投票。
印巴两国在克什米尔问题上的争端，近年来已主要集中在印占克什米尔地区穆斯林群众争取从印度的统治下独立出来而与印度进行的斗争上。自1990年以来，穆斯林群众与印度治安部队之间的冲突时断时续，已造成上万人伤亡。这不仅造成印占克什米尔地区局势的混乱，也导致了印巴两国关系的紧张。印度指责巴基斯坦支持穆斯林分离主义分子，干涉了印度的内政。巴基斯坦则谴责印度政府在印占克什米尔践踏人权，剥夺了人民的自决权。两国相互攻讦，互不相让。
由于克什米尔问题对印巴两国来说都涉及根本利益，势在必得，因此，40多年来，这一问题一直得不到根本解决。印巴两国历届政府都不敢在这一问题上轻易让步，因此，它的彻底解决尚需时日。无论对巴基斯坦的贝·布托政府还是对印度的拉奥政府来说，克什米尔问题都是令人头疼的最棘手的问题。印巴两国在克什米尔问题上一直变奏着战争与和平的旋律。在经历了三次战争之后，印巴两国人民都渴望和平，国际社会也强烈希望印巴两国和平解决争端。因此，印巴两国今后在克什米尔争端上将会以和平解决为主旋律，但会不时出现颤音。
克什米尔呼唤和平！
与克什米尔问题引发的印巴关系紧张密切相关的，是印巴两国的军备竞赛问题，特别是核问题。原子弹，这一人类头顶上高悬着的达摩克利斯之剑也给印巴关系蒙上了厚厚的阴影。
印度和巴基斯坦是否已拥有核武器，还没有得到证实。但是，毋庸置疑，它们已拥有研制核武器的能力。
不参加防止核扩散条约、独自进行核武器研制的印度，已于1974年在拉贾斯坦邦波卡兰进行过核试验，并取得了成功。印度研制核武器的中心机构原子能委员会主席巴拉姆，1994年5月在接受有影响的杂志《今日印度》的采访时，虽然没有直接谈及印度是否在制造核武器，但是他说：“印度拥有广泛的核技术，没有办不到的事”。
同样没有参加防止核扩�